生物工程专业是一门涉及生物和非生物领域的交叉学科，在医学、生产和环境等领域具有广泛的应用。江西中医药大学科技学院生物工程专业主要课程包含：

课程一：生物化学

生物化学是研究生命体系的基本化学过程和生物分子合成、代谢、调控等方面的一门基础课程。在生物工程专业中，生物化学课程旨在培养学生对生物分子基本结构和生物分子在代谢中的作用机理的认识，为理解分子生物学和发展基因工程、生物技术提供基础。

课程二：生物物理学

生物物理学是研究生物体和生物分子在物理学、生物化学和分子生物学等方面的物理过程和规律的一门基础课程。在生物工程专业中，生物物理学课程旨在培养学生对生物分子结构与生物学功能关系的认识，为深入了解细胞生物学、分子生物学等相关领域打好基础。

课程三：生物工程学基础

生物工程学基础是生物工程学的基础理论和方法论，主要内容包括细胞工程、分子生物工程、生化工程、微生物工程等方面。在生物工程专业中，生物工程学基础课程旨在培养学生对生物工程学基础理论及其应用进行深入了解，为今后的专业课程学习和从事生物工程领域的研究和工作打下坚实的基础。

课程四：发酵工程学

发酵工程学主要涉及微生物、废水、废气等生物反应器过程的综合应用的一门课程。在生物工程专业中，发酵工程学课程旨在培养学生掌握生物反应器的运行原理、发酵工艺过程控制技术、发酵工程中的微生物变异与改造技术、废水处理技术等知识，为今后的工程技术研究和应用提供理论基础。

课程五：生物制药工程学

生物制药工程学涉及到生物医药领域中的制药技术、制药过程、药物安全性和临床应用等方面的知识。在生物工程专业中，生物制药工程学课程旨在培养学生了解生物制药领域的制药核心技术、药物研发的基本流程、药物生产中的生物反应器等技术，为今后从事生物制药研究及应用提供基础。

总结

以上是江西中医药大学科技学院生物工程专业的主要课程，在这些课程的学习过程中，学生可以深入了解和掌握生物工程学和生物医药学的基础理论和核心技术，为今后的发展打下坚实基础。